汉代属毋敛县,王莽时毋敛县改称有敛县。唐代置石牛县,属南寿州治。宋代置中平县,大观四年,废中平县,并入庆远府河池县。元代置独山州蛮夷军民长官司。明代弘治七年(公元1494年)设置独山州。民国改设独山县,将三脚屯州峒分设三合县,后为贵州省八个行政督察区中的第二行政督察区的专员公署所在地,时为贵州省的第四大城市,国统区第十四大城市。1949年11月19日解放,将贵州省第二行政督察区改设为独山专区。1957年独山县,荔波县,平塘县(部分)三县合并,1961年三县分设,独山县沿用。